外部変数セット名などを変更した場合、その外部変数セットを参照しているフローなどがあるとそのままでは変更が反映されずに実行エラーになります。

これらの変更を反映させるには、「外部変数セットの編集」ダイアログボックスの「参照確認」ボタンをクリックするか、外部変数セットを右クリックして表示されるメニューの「変数参照の検索」をクリックするなどして、参照先のプロジェクトを更新してください。

詳しくは「フローサービスマニュアル」の「フローデザイナー」-「外部変数セット」-「編集した内容を参照元に反映する」を参照してください。